NRC pre meningokoky - ÚVZ SR
Národné referenčné centrum pre meningokoky
NRC pre meningokoky zriadené Ministerstvom zdravotníctva SR rozhodnutímč. 1814/1990-A/III-3 zo dňa 22. 10. 1993.
Personálne obsadenie
- RNDr. Anna Kružlíková: vedúca NRC, VŠ: klinický mikrobiológ s atestáciou I+II
Kontakt:
E-mail: anna.kruzlikova@uvzsr.sk
Telefón: +421/918 360 039
www.uvzsr.sk
- Jarmila Blažíčková, Zuzana Bucherová: zdravotnícke bakteriologické laborantky
Akreditácia
- podľa STN EN ISO/IEC 15129:2013
Činnosť NRC
Odborná činnosť: Výročné správy NRC
NRC vykonáva a zodpovedá za komplexnú fenotypizačnú, genotypizačnú nadstavbovú diagnostiku a konfirmáciu kmeňov N. meningitidis izolovaných z invazívnych meningokokových ochorení, lokálnych a urogenitálnych infektov ako aj identifikáciu cirkulujúcich nosičských kmeňov na území SR. V niektorých závažných prípadoch aj priamu diagnostiku a to keď biologický materiál je transportovaný priamo do NRC z oddelení ako je ARO, JIS, infekčné a detské kliniky a vždy z ÚDZS - patologicko anatomických/súdno-lekárskych pracovísk. Ďalšou úlohou NRC pre meningokoky je každoročne čo najkomplexnejšie zmapovať situáciu invazívnych meningokokových ochorení a cirkuláciu nosičských kmeňov, monitorovať jej vývoj na území SR a porovnať ju so situáciou v Európe a vo svete. NRC monitoruje citlivosť, rezistenciu a jej mechanizmy u meningokokov voči vybraným ATB pre profylaktické a terapeutické použitie. Taktiež sa venuje záchytu atypických metabolických fenotypov N.meningitidis a kmeňov spôsobujúcich odlišnú, pre meningokokové invazívne ochorenie, atypickú kliniku.
- Genotypizačnú identifikáciu kmeňov NRC realizuje pomocoureal time PCR pre potvrdenie druhu N. meningitidis a určení genoskupiny. Molekulárna diagnostika môže potvrdiť patogéna aj z kultivačne, mikroskopicky a aglutinačne negatívnych primárnych biologických materiálov. Nie je limitovaná začatou antibiotickou terapiou.
- K nevyhnutnému celosvetovému dohľadu podľa WHO, ECDC, EMGM nad meningokokovými ochoreniami patrí aj sledovanie cirkulácie, distribúcie a vývoja špecifických meningokokovýchklonov, ktoré NRC realizuje.
- NRC pre meningokoky úspešne realizuje a interpretuje genotypizáciu invazívnych a vybraných neinvazívnych kmeňov N. meningitidis s využitím externého prevádzkovateľa PRIF UK a Vedeckého parku UK v Bratislave. Invazívne kmene sú molekulárne analyzované multilokusovou sekvenčnou typizáciou (MLST) a celogenómovou sekvenáciou (WGS) podľa európskej schémy pre invazívne kmene:
séroskupina: PorA(vr1):PorA(vr2):FetA(vr1):klonálny komplex,sekvenčný typ - NRC sa podiela na integrácii molekulárnej a genomickejtypizácie invazívnych kmeňov v rámci celoeurópskej surveillance.
- Okrem toho sa v NRC pomocou WGS identifikujú gény pre poríny PorA (vr1,2,3), potenciálne bodové mutácie v génoch PenA, vakcinačné antigény – FHBP, NHBA, NadA, gény virulencie FetA. Všetky tieto požadované molekulárne charakteristiky vrátane klonálnych komplexov a sekvenčných typov invazívnych a vybraných neinvazívnych kmeňov, NRC odosiela pravidelne každoročne do medzinárodných sietí.
- NRC pre meningokoky je začlenené do medzinárodných projektov a aktivít: European Meningococcal and Haemophilus Disease Society (EMGM Society), ktorého je aj členom od roku 2019. V rámci aktivít EMGM prebiehajú projekty IBD-LabNet (Invasive Bacterial Disease Laboratory Network) a EMERT (European Meningococcal Epidemiology in Real Time), ktorých sa NRC zúčastňuje. Dáta klasickej a molekulárnej surveillance invazívneho meningokokového ochorenia sú hlásené do databázy TESSy (The European Surveillance System) a do databázy PubMLST (Public databases for molecular typing and microbial genome diversity).
- Z fenotypizačných metód NRC praktizuje svetelnú mikroskopiu Gramom farbených preparátov biologického materiálu z invazívnych ochorení vrátane vzoriek post mortem, pre stanovenie Gram negatívnych diplokokov a zmnožených polymorfonukleárnych leukocytov. Kultivačný dôkaz na 5 %-nom krvnom agare a pomnoženie v živnom bujóne u invazívnych a neinvazívnych kmeňov. Testy biochemickej identifikácie (oxidáza, ONPG, metabolizmus cukrov, dôkaz enzýmov) sa vykonávajú u všetkých kultivačných invazívnych izolátov, izolátov z dolých dýchacích ciest a z urogenitálneho systému. Séroskupiny sa stanovujú na základe polysacharidového antigénu bakteriálneho púzdra - určovanie séroskupín sklíčkovou aglutináciou s polyvalentnými (Poly, Poly2) a monovalentnými (A, B, C, D, Y, W135, X, E, Z, H) špecifickými antisérami u invazívnych kmeňov, kmeňov z dolných dýchacích ciest a urogenitálneho systému. Z ďalších fenotypizačných metód NRC praktizuje latexovú aglutináciu, ktorá obsahuje určovanie séroskupín A, B/K1, C, W135/Y + potenciálnu prítomnosť E. coli K1, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Streptococcus agalactiae v primárne sterilných tekutinách a u invazívnych kultivačných izolátov N. meningitidis.
- Celoročné testovanie kvantitatívnej antibiotickej citlivosti voči PNC, CTX, CTR, CIP, RIF (MIC mg/L, EUCAST)
- NRC pre meningokoky, ako člen európskych národných referenčných centier, pravidelne zasiela a aktualizuje komplexné molekulárne charakteristiky invazívnych kmeňov N. meningitidis (real-time PCR identifikácia a genoskupiny, WGS, MLST –multilocus sequence typing), typizácia a subtypizácia proteínov vonkajšej membrány a vakcinačných antigénov menB: PorA –VR1,VR2,VR3 FetA, NadA, FHBP, NHBA, určovanie klonálnych komplexov CC a sekvenčných typov ST, génov ATB rezistencie) do európskej databázy prostredníctvom systému EMERT (European Meningococcal Epidemiology in Real Time) v rámci EMGM (The European Meningococcal and Haemophilus Disease Society). Tieto údaje poskytuje aj pre EPIS,TESSy (The European Surveillance System), kde okrem toho poskytuje aj výsledky fenotypizačných metód (mikroskopia, určenie séroskupiny rýchlymi aglutinačnými metódami a MIC mg/L PNC, CTX, CIP a RIF). Spolupracuje v EU-IBD Labnet (European Invasive Bacterial Diseases Labnet) a EMGM, zameranej na molekulárne metódy identifikácie a monitoringu meningokokov v Európe.
- NRC vedie databázu údajov o všetkých zasielaných izolátoch N. meningitidis a pôvodnom biologickom materiáli, ako aj informácie o všetkých prípadoch invazívnych ochorení vrátane úmrtí na Slovensku. V spolupráci s UDZS, s epidemiológmi, s nemocničnými odd. intenzívnej medicíny, s infekčnými a pediatrickými klinikami a s laboratóriami klinických mikrobiológií, dosahujevyše 95 %-nú konfirmáciu všetkých meningokokových ochorení v SR. Archivuje, udržuje zbierku invazívnych a nosičskýchmeningokokov v kryobankách spolu s referenčnými kmeňmi (-70 °C).
- NRC priebežne dopĺňa a aktualizuje dokumentáciu a udržiava v praxi procesy v súvislosti s procesným auditom systému manažérstva kvality podľa ISO 9001:200 na ÚVZ SR.
- NRC podáva odborné konzultácie spolupracujúcim laboratóriam klinickej mikrobiológie, nemocničným klinikom, súdno-lekárskym a patologicko-anatomickým pracoviskám UDZS (interpretácie nálezov pri úmrtiach), pre metodické usmernenie manažmentu zasielania a výberu biologického materiálu na vyšetrenie v NRC, požadovaných analýz, výsledkov, laboratórnej diagnostiky a antibiotickej citlivosti vrátane chemoprofylaxie, racionálny prístup k nosičstvu a aktívna imunizácia.
NRC sa pravidelne podieľa na výukovej činnosti študentov stredných a vysokých škôl v oblasti laboratórnej diagnostiky meningokokov, ktorí v rámci vzdelávacích stáží a exkurzií navštevujú pracoviská ÚVZ SR. - Pravidelná vedecko-medicínska publikačná a prednášková činnosť (k dispozícii na vyžiadanie)
Evidencia publikačnej činnosti